想要做出好的納豆發酵的温度非常重要，温度不夠會導致納豆出現不拉絲的情況，納豆發酵的温度應根據菌種的要求，菌種有高温菌種如“成瀨菌”為40-42度，低温菌種如“高橋菌”為38-40度。
解決方法：
納豆發酵中儘量讓豆子處於40度左右，温差不可過大，納豆不要鋪的太厚，散熱不好，豆子温度過高，以不超過4cm為佳。
納豆菌活性不夠
做納豆用的納豆發酵菌要有活性，有的納豆菌活性很低做出來的納豆就有可能出現不拉絲的情況。
解決方法：
更換不同批次或者不同品牌的菌種。
菌種被污染
納豆不拉絲有可能是由於菌種或者發酵容器被污染而導致發酵不完全， 納豆菌受到噬菌體侵蝕時，可導致發酵異常，製品黏性不強或全無黏性。為避免噬菌體的感染，應該準備不同的納豆菌種輪換使用，適當增加菌種量，使納豆菌在短時間內生長旺盛，以減少噬菌體的危害。
解決方法：
1、如果是用納豆機做納豆需要進行徹底的消毒，先用洗潔精整個擦拭一遍，再用乾淨毛巾擦乾淨，內外均勻噴75%酒精消毒，放到通風處晾乾。為了保證納豆質量的穩定，最好不用納豆機發酵酸奶和米酒。
2、納豆發酵前3小時，在發酵箱內均勻噴75%醫用酒精，開箱通風讓酒精揮發即可或在納豆發酵前用紫外線燈照射發酵箱15分鐘，然後開箱通風如用臭氧消毒，比較徹底。
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