原材料不同。苦蕎茶主要以苦蕎為主,苦蕎的種類有兩類:普通苦蕎和黑苦蕎,常見的普通苦蕎為黃白色黑苦蕎外殼呈現深黑色。蕎麥茶則是以蕎麥為主,蕎麥在生長過程中葉片會呈現紅色或者綠色。市面上常見的為蕎麥茶,食用價值更高,苦蕎數量遠少於蕎麥,用苦蕎做茶並不是很常見。
兩者之間的區別在於苦蕎茶是經過苦蕎脱殼、晾曬、烘乾等多道工藝用苦蕎麥的仁經過特殊工藝精製而成,它含有生物類黃酮蘆丁以及18種氨基酸和多種微量元素私維生素,經常喝有屬於樂請熱去火的功效。
苦蕎麥屬於禾穀類,麥類屬於小宗糧豆作物,能當飯吃,營養相當豐富,比苦蕎茶又多含了粗蛋白,礦物質等營養,可以做成河撈,碗託十分美味。